为保持洁净车间的净化效果，必须对其进行清洗。
在洁净车间，对主、支风管道清洁组的工作进行监督管理，对洁净车间的组员进行施工技术指导。清洁风管应分区域、分阶段进行，清洁车间的清洁工作段和非清洁工作段之间，清洁风管和连通室内区域之间，应采取有效的空气隔离措施(即针对问题的解决办法)。
二、对零件清洗组的工作监督管理，指导组员施工技术，用专用工具、器械对零件进行清洗，清洗后零件达到相关标准要求，零件可直接清洗，或拆下后进行清洗，清洗后零件要恢复原位，可调零件也应恢复原位。
三、清洁车间，对组的工作进行监督管理，指导组的施工技术和严格的标准，清洁达到相应卫生要求后，对管道、部件和冷却塔进行处理，并做好记录。气道时，将喷头安装在清洗机器人上，让剂通过机被送到喷头，喷雾从内部向外部喷出，边退边喷，这样可以避免再污染。药剂的选择是在保证效果的前提下，对风管和设备伤害较小，必要时后要及时冲洗通风，防止液残留对人体和设备造成危害。
四、监督管理净化车间冷却塔清洁队的工作，指导清洁队施工工艺。无尘室车间空气常温除尘，高温空气净化，空气过滤，在工作场所吸尘。适用行业：木制品、橡胶、塑料、采矿、玻璃陶瓷、颜料、电子、医药、纺织印染、电镀、机械制造、化工、钢铁冶炼、化肥农药等。先排出冷却水，再对冷却塔内壁进行彻底清洗，达到表面无污染物。若在冷却水中发现致病微生物，则先用化学方法或剂处理冷却水，再将塔内水排出，并对塔内壁进行彻底清洗。
公司应合理安排人员定期清洗、管理，并将其责任落实到人，以确保车间的洁净度。无尘车间洁净度和持续稳定的污染控制是检验无尘车间质量的核心标准，依据区域环境、净化程度等因素，分为几个等级，常用的有国际标准和国内区域工业标准，一些知名无尘工程公司，在通行标准之外，还有自己执行的净化指标高于国际通行标准，净化能力和环境适应力远超国际品牌。清洁车间净化厂房内墙、顶板一般多采用50mm厚的夹心彩板制作，其特点是美观，刚性强。弧形角、门、窗框等一般采用专用氧化铝型材，地面可采用环氧自流式平地或耐磨塑料地板，如有防静电要求，可选用防静电型。
